Génétique et Écologie Évolutives
L’équipe de recherche Génétique et Écologie Évolutives (GEE) développe des thématiques de recherche en génétique, génomique, écologie et évolution. Nous nous intéressons à l’écologie et à l’évolution des champignons, des bactéries, des insectes, des plantes et des oiseaux, aux interactions entre espèces (notamment hôtes-parasites) et à la génomique évolutive de l’adaptation.
Nous cherchons à comprendre l’adaptation des espèces et des populations à leur environnement, et à identifier les gènes et mécanismes impliqués. Nos modèles biologiques sont les champignons pathogènes de plantes, les champignons (notamment Penicillium) domestiqués du fromage et des charcuteries, les bactéries pathogènes de l’Homme (Mycobacterium tuberculosis), les pommiers cultivés, Arabidopsis et ses parasites, ainsi que les oiseaux et leurs microbes associés.
RESPONSABLE : Tatiana Giraud
MEMBRES PERMANENTS
Tatiana Giraud, Fanny Hartmann, Juergen Kroymann, Amandine Labbat, Anders Møller, Guislaine Refrégier, Ricardo Rodriguez de la Vega, Jeanne Ropars, Jacqui Shykoff, Alodie Snirc
DOCTORANTS
Amira Boukherissa, Ewen Crequer, Adrien Le Meur, Emilie Tezenas du Moncel, Pierre Véron, Elsa de Filipo
POST-DOC ET CONTRACTUELS
Agathe Ballu, Lorelei Boyer, Antonio Camara, Thibault Caron, Elizabeth Makhoul Chahine, Marine Duhamel, Elise Lucotte, Samuel O’Donnell, Marina Pfalz, Pauline Michel, Gabriela Rezende, Quentin Rougemont, Jean-Philippe Vernadet, Rima Zein-Eddine.
Axes de recherche :
Domestication des champignons du fromage et du saucisson
Génomique de l’adaptation chez les champignons pathogènes
Evolution des chromosomes de type sexuel
Domestication des pommiers
Infections multiples et évolution de la virulence chez les champignons pathogènes
Spéciation et spécialisation chez les champignons pathogènes
Invasions biologiques de champignons pathogènes
Changement climatique et conséquences écologiques et sur l’évolution
Conséquences écologiques et sur l’évolution de Tchernobyl
Co-évolution parasite-hôte
Sélection sexuelle et l’évolution des caractères sexuels secondaires
L’écologie et l’évolution de l’urbanisation
Fonction et évolution des systèmes de défense des plantes
Evolutions des contre-adaptations contre les défenses de plantes
Ecologie des oiseaux
Interactions oiseaux – microbes
Evolution des toxines
Evolution du bacille tuberculeux