Marine Duhamel

Poste : Doctorante

Équipe : Génétique et Écologie Évolutives

Coordonnées :
Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution – IDEEV
Bât. 680 – 12, route 128
91190 Gif Sur Yvette

Tél :

Fax :

Email : marine.duhamel (at) universite-paris-saclay.fr

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Activités de recherche

En thèse en cotutelle Université Paris-Saclay – Ruhr-Universität Bochum co-encadré par Tatiana Giraud et Dominik Begerow, je travaille sur l’adaptation des champignons pathogènes de plantes du genre Microbotryum. Ma recherche porte sur les mécanismes génomiques d’adaptation à l’hôte chez ces champignons, ainsi que l’évolution de leurs chromosomes de type sexuel. Les champignons pathogènes de plantes sont généralement hautement spécialisés sur un espèce hôte ; cependant des sauts d’hôte peuvent se produire et causer des maladies émergentes qui sont un enjeu majeur dans les systèmes agronomiques. Il est donc important de mieux comprendre les bases génomique de l’adaptation chez les champignons pathogènes. Par ailleurs, les processus d’évolution des chromosomes de type sexuels ne sont pas encore bien connus. Je m’intéresse tout particulièrement à la dynamique d’accumulation des éléments transposables dans les régions non-recombinantes des chromosomes de type sexuels des champignons du genre Microbotryum, ainsi que dans leur génome en général.

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Parcours

2018-2021: Doctorat à l’Université Paris Saclay (France) et l’Université de la Ruhr à Bochum (Allemagne) encadré par Tatiana Giraud et Dominik Begerow. Les mécanismes génomiques impliqués dans la spécialisation à l’hôte chez les champignons du genre Microbotryum.

2016-2018: Master Bioinformatique à l’Université Paris Sud, France

2014-2016 : Master Biologie-Santé parcours Sciences du Végétal à l’Université Paris-Sud, France

2011-2014 : Licence Biologie des organismes et écologie à l’Université Paris-Sud, France

2011 : Baccalauréat Scientifique au lycée Gustave Flaubert, Rouen, France

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Publications

Beckerson, WC, Rodriguez de la Vega, RC, Hartmann, FE, Duhamel, M, Giraud, T, Perlin, MH (2019). Cause and Effectors: Whole-Genome Comparisons Reveal Shared but Rapidly Evolving Effector Sets among Host-Specific Plant-Castrating Fungi. mBio, 10:e02391-19.

Kumar, R, Duhamel, M, Coutant, E, Ben-Nahia, E, Mercier, R (2019). Antagonism between BRCA2 and FIGL1 regulates homologous recombination. Nucleic Acids Res., 47, 10:5170-5180.

Fernandes, JB, Duhamel, M, Seguéla-Arnaud, M, Froger, N, Girard, C, Choinard, S, Solier, V, De Winne, N, De Jaeger, G, Gevaert, K, Andrey, P, Grelon, M, Guerois, R, Kumar, R, Mercier, R (2018). FIGL1 and its novel partner FLIP form a conserved complex that regulates homologous recombination. PLoS Genet., 14, 4:e1007317.