Marine Duhamel

Poste : Post-doctorante

Équipe : Génétique et Écologie Évolutives

Coordonnées :
Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution – IDEEV
Bât. 680 – 12, route 128
91190 Gif Sur Yvette

Tél :

Fax :

Email : marine.duhamel (at) universite-paris-saclay.fr

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Activités de recherche

Post-doctorante supervisée par Tatiana Giraud (GEE), je travaille sur l’évolution des chromosomes de types sexuels chez les champignons. Mes travaux se concentrent sur l’accumulation des éléments transposables dans les régions non-recombinantes des chromosomes de types sexuels chez les champignons, ainsi que dans leur génome en général. Je travaille principalement sur les champignons pathogènes castrateurs de plantes du genre Microbotryum, qui causent la maladie du charbon. Plus généralement, je m’intéresse à la génomique évolutive, à la recombinaison et à la dynamique des génomes.

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Parcours

2022-2023: Post-doctorat à l’Université Paris Saclay (France) supervisé par Tatiana Giraud sur l’évolution des régions non-recombinantes des chromosomes de type sexuels chez les champignons du genre Microbotryum.

2018-2022: Doctorat à l’Université Paris Saclay (France) et l’Université de la Ruhr à Bochum (Allemagne) dirigée par Tatiana Giraud et Dominik Begerow, co-encadrée par Ricardo Rodriguez de la Vega. Evolution des régions non-recombinantes des chromosomes de types sexuels et dynamique des éléments transposables chez les champignons.

2016-2018: Master Bioinformatique à l’Université Paris Sud, France

2014-2016 : Master Biologie-Santé parcours Sciences du Végétal à l’Université Paris-Sud, France

2011-2014 : Licence Biologie des organismes et écologie à l’Université Paris-Sud, France

2011 : Baccalauréat Scientifique au lycée Gustave Flaubert, Rouen, France

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Publications

Duhamel M, Hood ME, Rodríguez de la Vega RC, Giraud T. (2022). Dynamics of transposable element accumulation in the non-recombining regions of mating-type chromosomes in anther-smut fungi. bioRxiv, 2022.08.03.502670.

Carpentier F, Rodríguez de la Vega RC, Jay P, Duhamel M, Shykoff JA, Perlin MH, Wallen RM, Hood ME, Giraud T. (2022). Tempo of Degeneration Across Independently Evolved Nonrecombining Regions. Molecular Biology and Evolution 39: msac060.

Duhamel M, Carpentier F, Begerow D, Hood ME, Rodríguez de la Vega RC, Giraud T. (2022). Onset and stepwise extensions of recombination suppression are common in mating-type chromosomes of Microbotryum anther-smut fungi. Journal of Evolutionary Biology, 10.1111/jeb.13991.

Hartmann FE, Duhamel M, Carpentier F, Hood ME, Foulongne‐Oriol M, Silar P, Malagnac F, Grognet P, Giraud T. (2021). Recombination suppression and evolutionary strata around mating‐type loci in fungi: documenting patterns and understanding evolutionary and mechanistic causes. The New Phytologist 229: 2470–2491.

Beckerson, WC, Rodriguez de la Vega, RC, Hartmann, FE, Duhamel, M, Giraud, T, Perlin, MH (2019). Cause and Effectors: Whole-Genome Comparisons Reveal Shared but Rapidly Evolving Effector Sets among Host-Specific Plant-Castrating Fungi. mBio, 10:e02391-19.

Kumar, R, Duhamel, M, Coutant, E, Ben-Nahia, E, Mercier, R (2019). Antagonism between BRCA2 and FIGL1 regulates homologous recombination. Nucleic Acids Res., 47, 10:5170-5180.

Fernandes, JB, Duhamel, M, Seguéla-Arnaud, M, Froger, N, Girard, C, Choinard, S, Solier, V, De Winne, N, De Jaeger, G, Gevaert, K, Andrey, P, Grelon, M, Guerois, R, Kumar, R, Mercier, R (2018). FIGL1 and its novel partner FLIP form a conserved complex that regulates homologous recombination. PLoS Genet., 14, 4:e1007317.