Fanny HARTMANN

Fanny Hartmann

Poste : Maître de conférences

Équipe : Génétique et Écologie Évolutives

Coordonnées :
Laboratoire Écologie, Systématique, Évolution
Bât. 360, rue du Doyen André Guinier
91405 Orsay Cedex

Tél : +33 (0)1 69 15 72 82

Fax :

Email : fanny.hartmann (at) universite-paris-saclay.fr

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Activités de recherche

Mes projets de recherche concernent l’étude de l’évolution des génomes et les mécanismes responsables des processus adaptatifs et de divergence chez les êtres vivants en prenant les champignons comme modèles. J’utilise des approches de génomique évolutive.

J’étudie au sein de l’équipe Génétique et Ecologie Evolutives l’évolution des chromosomes des types sexuels des champignons, qui sont d’excellents modèles pour tester de nouvelles hypothèses d’évolution des chromosomes sexuels et des larges régions ayant des suppressions de recombinaison en général. Je suis aussi intéressée par le rôle des réarrangements chromosomiques, inversions et autres variations structurales, dans les processus de spécialisation, adaptation locale et divergence chez les champignons, notamment les pathogènes de plantes.

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Publications

Hartmann F.E., Snirc A., Cornille A., Godé C., Touzet P., Van Rossum F., Fournier E., Le Prieur S., Shykoff J., Giraud T. 2020. Congruent population genetic structures and demographic histories in anther-smut fungi and their host plants Silene nutans and S. italica. Molecular Ecology. doi:10.1111/mec.15387

Hartmann F.E., Rodríguez de la Vega R.C., Gladieux P., Ma W.-J., Hood M.E., Giraud T. 2019. Higher gene flow in sex-related chromosomes than in autosomes during fungal divergence. Molecular Biology and Evolution. msz252, doi:10.1093/molbev/msz252

Beckerson W.C., Rodríguez de la Vega R.C., Duhamel Marine, Hartmann F.E., Giraud T., Perlin M.H. 2019. Cause and Effectors: whole genome comparisons reveal shared but rapidly evolving effector sets among host-specific plant-castrating fungi. mBio. 10:e02391-19. doi:10.1128/mBio.02391-19. 

Hartmann F.E., Rodríguez de la Vega R.C., Carpentier F., Gladieux P., Cornille A., Hood M.E., Shykoff J., Giraud T. 2019. Understanding adaptation, coevolution, host specialization and mating system by combining population and comparative genomics in castrating anther-smut fungi. Annual Review of Phytopathology, 57:431-457. doi:10.1146/annurev-phyto-082718-095947

Hartmann F.E., Rodríguez de la Vega R.C., Brandenburg J.T., Carpentier F., Giraud T. 2018. Gene presence-absence polymorphism in castrating anther-smut fungi: recent gene gains and phylogeographic structure. Genome Biology and Evolution, 5:1298–1314. doi:10.1093/gbe/evy089

Branco S., Carpentier F., Rodríguez de la Vega R.C., Badouin H., Snirc A., Le Prieur S., Coelho M.A., de Vienne D.M., Hartmann F.E., Begerow D., Hood M.E., Giraud T. 2018. Multiple convergent supergene evolution events in mating-type chromosomes. Nature Communications. 9:2000. doi : 10.1038/s41467-018-04380-9.

Hartmann F.E., McDonald B.A., Croll D. 2018. Genome-wide evidence for divergent selection among populations of a major agricultural pathogen. Molecular Ecology. 1–17. doi :10.1111/mec.14711

Hartmann F.E., Croll D. 2017. Distinct trajectories of massive recent gene gains and losses in populations of a microbial eukaryotic pathogen. Molecular Biology and Evolution. 34:11. doi:10.1093/molbev/msx208

Hartmann F.E., Sánchez-Vallet A., McDonald B.A., Croll D. 2017. A fungal wheat pathogen evolved host specialization by extensive chromosomal rearrangements. The ISME Journal. 11:1189–1204. doi:10.1038/ismej.2016.196