Elise Lucotte

Position: Post-doctoral researcher
Detailed position: Post-doctoral researcher at CNRS on the evolution of mating-types chromosomes on Microbotryum spp

Team: Evolutionary genetics and ecology

Contact details:
Laboratoire Écologie, Systématique et Évolution – IDEEV
Université Paris Saclay
Office 2326 Build. 680 – 12, route 128
91190 Gif Sur Yvette

Tel:

Fax:

Email: elise.lucotte (at) universite-paris-saclay.fr

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Research interests

  • Evolution of mating type chromosomes and recombination suppression in Microbotryum spp
  • Evolution of sex chromosomes, in particular the ampliconic regions, in humans and other primates
  • Sex-antagonistic selection and sex-biased transmission distortion in humans
  • Population genetics in humans
Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Career path

2021 – 2023 : Post doctorat au CNRS, Université Paris-Saclay, Génétique et Écologie Évolutives avec Tatiana Giraud. Evolution et structure des chromosomes sexuels des espèces de Microbotryum infestant les Œillets.

2019 – 2021 : Post doctorat au Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations (CESP), Inserm, équipe Cancer et Environnement. Pléiotropie entre le cancer du sein et de la thyroïde.

2016 – 2019 : Post doctorat au Bioinformatics Research Center (BiRC), Université d’Aarhus, Danemark. Sous la direction de Mikkel Heide Schierup. Évolution des régions ampliconiques des chromosomes sexuels chez l’Homme et les primates non-humains.

2012 – 2015 : Doctorat en génétique des populations au Musée de l’Homme, Muséum national d’Histoire naturelle et Université Paris 6. Sous la direction de Bruno Toupance et Evelyne Heyer. Détection de processus sexuellement antagonistes dans le génome humain.

Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution

Publications

Submitted articles

– Study of the Icelandic population reveals extraordinarily high mutation rates of the Y-linked ampliconic regions in humans. A. Lucotte, V. Björt Guðmundsdóttir, J.M. Jensen, L. Skov, M. Coll Macia, A. Helgason, M.H. Schierup, K. Stefansson. Under minor revision in Nature Communications.

– Common genetic risks between breast cancer and thyroid disorders. E. A. Lucotte*, Yazdan Asgari*, P-E. Sugier, M. Karimi, F. Lesueur, A. Boland, E. Ostroumova, F. de Vathaire, P. Guénel, J-F. Deleuze, M-C. Boutron-Ruault, G. Severi, B. Liquet, T. Truong. Submitted to PloS Genetics.

Published articles

Investigation of Shared Genetic Risk Factors Between Parkinson’s Disease and Cancers (2023) P‐E. Sugier, E.A. Lucotte, C. Domenighetti, M.H. Law, M.M. Iles, K. Brown, C. Amos, J.D. McKay, R.J. Hung, M. Karimi, D. Bacq‐Daian, A. Boland‐Augé, R. Olaso, J‐F. Deleuze, F. Lesueur, E. Ostroumova, A. Kesminiene, F. de Vathaire, P. Guénel, EPITHYR consortium, […], Courage‐PD consortium, T. Truong, A. Elbaz. Movement Disorders https://doi.org/10.1002/mds.29337.

Extraordinary selection on the human X chromosome associated with archaic admixture (2023) L. Skov*, M.C. Macià*, E.A. Lucotte, M.I.A. Cavassim, D. Castellano, T. Mailund, M.H. Schierup, K. Munch. Cell Genomics https://doi.org/10.1016/j.xgen.2023.100274.

– Detection of sexually antagonistic transmission distortions in trio datasets (2022) E.A. Lucotte, C. Albinana, R. Laurent, C. Bhérer, Genome of the Netherland Consortium, T. Bataillon*, B. Toupance*. Evolution Letters https://doi.org/10.1002/evl3.271.

Multiethnic genome-wide association study of differentiated thyroid cancer in the EPITHYR consortium (2021) T. Truong, F. Lesueur, P-E. Sugier, J. Guibon, C. Xhaard, M. Karimi, O. Kulkarni, E.A. Lucotte, D. Bacq, A. Boland-Auge, C. Mulot, P. Laurent-Puig, C. Schvartz, A-V. Guizard, Y. Ren, E. Adjadj, F. Rachedi, F. Borson-Chazot, R. M. Ortiz, J. J. Lence-Anta, C. M. Pereda, D. F. Comiskey, H. He, S. Liyanarachchi, A. de la Chapelle, R. Elisei, F. Gemignani, H. Thomsen, A. Forsti, A. F. Herzig, A-L. Leutenegger, C. Rubino, E. Ostroumova, A. Kesminiene, M-C. Boutron-Ruault, J-F. Deleuze, P. Guenel, F. de Vathaire. International Journal of Cancer https://doi.org/10.1002/ijc.33488.

– The nature of Neanderthal introgression revealed by 27,566 Icelandic genomes (2020) L. Skov*, M. Coll Macià*, G. Sveinbjörnsson, Fabrizio Mafessoni, E.A. Lucotte, M.S. Einarsdóttir, H. Jonsson, B. Halldorsson, D.F. Gudbjartsson, A. Helgason, M.H. Schierup, K. Stefansson. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-020-2225-9.

– Dynamic copy number evolution of X- and Y-linked ampliconic genes in human populations (2018) E.A. Lucotte, L. Skov, J.M. Jensen, M. Coll Macià, K. Munch, M.H. Schierup. GENETICS doi : 10.1534/genetics.118.300826 (choisi comme « highlights » de Juillet 2018 par GENETICS)

– Detection of allelic frequency differences between the sexes in humans: a signature of sexually antagonistic selection (2016) E.A. Lucotte, R. Laurent, E. Heyer, L. Segurel, B. Toupance. Genome Biology and Evolution doi : 10.1093/gbe/evw090