Fanny HARTMANN

Je m’intéresse à l’évolution des génomes et les mécanismes responsables des processus adaptatifs et de divergence chez les êtres vivants. J’étudie les champignons comme modèles et j’utilise des approches de génomique évolutive.

Mes projets de recherche actuels concernent l’étude de l’évolution de larges régions de suppression de recombinaison sur les chromosomes des types sexuels chez les champignons de l’ordre des Sordariales et le rôle des réarrangements chromosomiques, comme les inversions, dans les processus d’adaptation chez les pathogènes de plantes.

L1, L2, L3 : Bioinformatique – Biologie Evolutive – Botanique – Ecologie –  Génétique des Populations – Informatique (programmation Python)

Master :Biologie Evolutive – Génomique des Populations

Hartmann FE, Vega RCR de la, Demené A, Badet T, Vernadet J-P, Rougemont Q, Labat A, Snirc A, Stauber L, Croll D, et al. 2025. An inversion polymorphism under balancing selection, involving giant mobile elements, in an invasive fungal pathogen.  Molecular Biology and Evolution. msaf026, https://doi.org/10.1093/molbev/msaf026

Vittorelli N., Rodriguez de la Vega R. C., Snirc A., Levert E., Gautier V., Lalanne C., De Filippo E., Gladieux P., Guillou S., Zhang Y., Tejomurthula S., Grigoriev I.V., Debuchy R., Silar P., Giraud T., Hartmann F.E. 2023. Stepwise recombination suppression around the mating-type locus in an ascomycete fungus with self-fertile spores (Ascomycota, Sordariales). PLoS Genet 19(2): e1010347.

Hartmann F.E. 2022. Using structural variants to understand the ecological and evolutionary dynamics of fungal plant pathogens. New Phytol. 234:43–49.

Hartmann F.E., Ament-Velásquez S.L., Vogan A.A., Gautier V., Le Prieur S., Berramdane M., Snirc A., Johannesson H., Grognet P., Malagnac F., Silar P., Giraud T. 2021. Size variation of the non-recombining region on the mating-type chromosomes in the fungal Podospora anserina species complex. Molecular Biology and Evolution. msab040, https://doi.org/10.1093/molbev/msab040

Hartmann F.E., Duhamel M., Carpentier F., Hood M.E., Foulongne-Oriol M., Silar P., Malagnac F., Grognet P., Giraud T. 2021. Recombination suppression and evolutionary strata around mating-type loci in fungi: documenting patterns and understanding evolutionary and proximate causes. New Phytologist Tansley review 229(5) 2470-2491

Hartmann F.E., Croll D. 2017. Distinct trajectories of massive recent gene gains and losses in populations of a microbial eukaryotic pathogen. Molecular Biology and Evolution. 34:11. doi:10.1093/molbev/msx208

Hartmann F.E., Sánchez-Vallet A., McDonald B.A., Croll D. 2017. A fungal wheat pathogen evolved host specialization by extensive chromosomal rearrangements. The ISME Journal. 11:1189–1204. doi:10.1038/ismej.2016.196