Sébastien OLLIER

Je m’intéresse à l’étude des processus de dispersion dans les socio-écosystèmes. L’objectif est de développer des méthodes statistiques permettant la caractérisation des processus spatiaux-temporelles lié à ces phénomènes de dispersion.

Mes recherches se concentrent autour de deux thématiques écologiques :

– Populations férales et dispersion du colza dans les agro-écosystèmes : évaluation des risques de contamination par les cultures transgéniques

– Impacts des mobilités induites par l’Homme (échanges commerciaux et migrations) sur les invasions biologiques, en particulier des fourmis

Financements

– ANR OGMBioimpact (2006-2010) coordonnée par Jane Lecomte : Gene flow in agroecosystem

– ANR RiskOGM (2011-2015) coordonnée par Jane Lecomte : Dispersal of oilseed rape transgenes : the precise role of insect pollinators and wind in effective pollen dispersal, and grains trucks in seed dispersal

– ANR FIRE (2013-2017) coordonnée par Franck Courchamp : Forecasting Invasion Risks for the Environment

Consultations

Certaines ont donné lieu à publications dans mon domaine d’expertise, les biostatistiques (Duminil et al. 2008, Benabdellah et al. 2010, Pustahija et al. 2013, Roturier et al. 2017), d’autres à des collaborations suivies avec :

• Damien de Vienne (CR au Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, Lyon) et Gabriela Aguileta  (post-doc au Center for Genomic Regulation, Barcelone) : développement d’outils dédiés à la comparaison d’arbres phylogénétiques pour l’étude des transferts de gènes.
• Elsa Bonnaud  (MCF au Laboratoire d’écologie, systématique et évolution, Paris XI) : étude de l’impact de l’introduction du chat domestique sur les réseaux trophiques.
• Cleo Bertelsmeier (post-doc au Département d’écologie et évolution, Lausanne) : étude des patrons spatio-temporels exprimés lors de la dispersion des fourmis (en particulier des fourmis invasives) sous l’influence des activités humaines.

Projet d’application cartographique : https://ollier.shinyapps.io/Test/

Mes activités d’enseignement portent essentiellement sur l’enseignement des biostatistiques (statistique exploratoire multidimensionnelle, statistique inférentielle, statistiques spatiales, modélisation statistique), et l’apprentissage des outils informatiques (logiciel R et SIG).

• Responsable de l’UE GEAS (Gestion et Analyse de Données Spatialisées) du master EBE

• Implication dans plusieurs UE de Biostatistiques

• Gyda Fenn-Moltu, thèse co-encadrée avec Cleo Bertelsmeier (UNIL – Lausanne) : Impacts of globalization on biological invasions.
• Sarah Piffaretti (en cours), étudiante en M1. Does recent human history govern the lobal spread of the worst invasive species?
• Clément Brusq (2017-2018), étudiant en M1. Evolution de la niche climatique de fourmis invasives.
• Amandine Confais (2015-2016), étudiante en post-M2. Etude bibliographique sur le déterminisme de l’invasion par Lasius neglectus.
• Gwendal Restoux (2013-2014), étudiant en post-doc. Analyse et modélisation de la dispersion à longue distance des graines de colza dans un agroecosystème.
• Diane Bailleul (2010-2012), étudiante en thèse (co-encadrée avec Jane Lecomte). Dispersion des graines de colza (Brassica napus L.) et origines des populations férales dans un agroécosystème
• David Feutrie (2012), étudiant en Magistère de Mathématiques, L3. Mesures de l’hétérogénéité spatiale d’un paysage.
• Aurélien Saghaï (2010), étudiant en biologie, L2. Etude de l’hétérogénéité génétique dans les champs et dans les populations de colza.
• Yann Pottier (2009), étudiant en Master EBE, M2. Evaluation des risques liés à l’introduction de transgénique : étude de faisabilité d’une analyse de la structure génétique du paysage sur la base des fréquences alléliques des marqueurs microsatellites

• Fordham, D. A., C. Bertelsmeier, B. W. Brook, R. Early, D. Neto, S. C. Brown, S. Ollier, and M. B. Araújo. 2018. How complex should models be? Comparing correlative and mechanistic range dynamics models. Global Change Biology 24:1357–1370.
• Bertelsmeier, C., S. Ollier, A. M. Liebhold, E. G. Brockerhoff, D. Ward, and L. Keller. 2018. Recurrent bridgehead effects accelerate global alien ant spread. Proceedings of the National Academy of Sciences 115:5486–5491.
• Roturier, S., S. Ollier, L.-E. Nutti, U. Bergsten, and H. Winsa. 2017. Restoration of reindeer lichen pastures after forest fire in northern Sweden: Seven years of results. Ecological Engineering 108:143–151.
• Bertelsmeier, C., S. Ollier, A. Liebhold, and L. Keller. 2017. Recent human history governs global ant invasion dynamics. Nature Ecology & Evolution 1:0184.
• Bailleul, D., S. Ollier, and J. Lecomte. 2016. Genetic Diversity of Oilseed Rape Fields and Feral Populations in the Context of Coexistence with GM Crops. PLOS ONE 11:e0158403.
• Bertelsmeier, C., S. Ollier, A. Avril, O. Blight, H. Jourdan, and F. Courchamp. 2016. Colony–colony interactions between highly invasive ants. Basic and Applied Ecology 17:106–114.
• Bertelsmeier, C., and S. Ollier. 2016. Questioning Holocene community shifts. Nature 537:E4–E5.
• Bonnaud, E., P. Palmas, K. Bourgeois, S. Ollier, D. Zarzoso-Lacoste, and E. Vidal. 2015. Island specificities matter: cat diet differs significantly between islands of a major breeding archipelago for a vulnerable endemic seabird. Biological Invasions 17:2927–2941.
• Pustahija, F., S. C. Brown, F. Boguni?, N. Baši?, E. Muratovi?, S. Ollier, O. Hidalgo, M. Bourge, V. Stevanovi?, and S. Siljak-Yakovlev. 2013. Small genomes dominate in plants growing on serpentine soils in West Balkans, an exhaustive study of 8 habitats covering 308 taxa. Plant and Soil 373:427–453.
• de Vienne, D. M., S. Ollier, and G. Aguileta. 2012. Phylo-MCOA: A Fast and Efficient Method to Detect Outlier Genes and Species in Phylogenomics Using Multiple Co-inertia Analysis. Molecular Biology and Evolution 29:1587–1598.
• Bailleul, D., S. Ollier, S. Huet, A. Gardarin, and J. Lecomte. 2012. Seed Spillage from Grain Trailers on Road Verges during Oilseed Rape Harvest: An Experimental Survey. PLoS ONE 7:e32752.
• de Vienne, D. M., G. Aguileta, and S. Ollier. 2011. Euclidean Nature of Phylogenetic Distance Matrices. Systematic Biology 60:826–832.
• Benabdellah, M. A., S. M. Amrani, A. Elhaitoum, and S. Ollier. 2010. Analyse phytoécologique des groupements à thuya et à chêne vert dans les monts de Tlemcen. Ecologia mediterranea 36:97–120.
• Pavoine, S., S. Ollier, D. Pontier, and D. Chessel. 2008. Testing for phylogenetic signal in phenotypic traits: new matrices of phylogenetic proximities. Theoretical population biology 73:79–91.
• Duminil, J., D. Grivet, S. Ollier, S. Jeandroz, and R. J. Petit. 2008. Multilevel control of organelle DNA sequence length in plants. Journal of molecular evolution 66:405–15.
• Ollier, S., P. Couteron, and D. Chessel. 2006. Orthonormal transform to decompose the variance of a life-history trait across a phylogenetic tree. Biometrics 62:471–7.
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• Couteron, P., and S. Ollier. 2005. A generalized, variogram-based framework for multi-scale ordination. Ecology 86:828–834.
• Pavoine, S., S. Ollier, and D. Pontier. 2005. Measuring diversity from dissimilarities with Rao’s quadratic entropy: are any dissimilarities suitable? Theoretical population biology 67:231–9.
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• Bailleul, D., S. Ollier, A. Garnier, D. Sigaud, and J. Lecomte. 2010. Estimation de la dispersion des graines à l’échelle des paysages?: le cas des populations férales de colza. Page Premier colloque national sur l’Ecologie. Montpellier, France.
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